42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1717 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
214 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  60.28 
 
 
214 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  54.46 
 
 
211 aa  231  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  52.88 
 
 
212 aa  207  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  56.48 
 
 
214 aa  201  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  59.68 
 
 
210 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  48.21 
 
 
208 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  51.58 
 
 
183 aa  180  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  49.55 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  49.09 
 
 
218 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  49.09 
 
 
218 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  47.52 
 
 
211 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  51.34 
 
 
211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  51.1 
 
 
197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  42.38 
 
 
223 aa  165  4e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  47.46 
 
 
220 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  44.06 
 
 
223 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  42.52 
 
 
210 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  52.33 
 
 
181 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  50.26 
 
 
190 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  47.72 
 
 
201 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  40.1 
 
 
223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  39.72 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  39.11 
 
 
219 aa  126  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  40.91 
 
 
246 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  37.07 
 
 
198 aa  124  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  47.11 
 
 
205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  37.57 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  36.36 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.36 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  34.32 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  34.03 
 
 
215 aa  87.4  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  35.07 
 
 
220 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  28.1 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  60.5  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  38.54 
 
 
139 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  32.67 
 
 
142 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  26.81 
 
 
301 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  30.21 
 
 
125 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  28.67 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  28.49 
 
 
390 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  30.97 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>