41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1549 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
212 aa  424  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  53.93 
 
 
211 aa  214  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  50.94 
 
 
214 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  54.89 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  54.89 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  54.89 
 
 
218 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  52.38 
 
 
210 aa  187  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  47.34 
 
 
208 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  52.43 
 
 
183 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  47.87 
 
 
211 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  48.42 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  52.54 
 
 
220 aa  181  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  52.51 
 
 
211 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1717  Vitamin K epoxide reductase  52.88 
 
 
214 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.109797  normal  0.967803 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2664  Vitamin K epoxide reductase  48.42 
 
 
201 aa  171  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2627  Vitamin K epoxide reductase  48.4 
 
 
190 aa  168  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116048  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4428  vitamin K epoxide reductase  49.39 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2772  Vitamin K epoxide reductase  52.13 
 
 
181 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0263132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2148  Vitamin K epoxide reductase  41.85 
 
 
223 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000129835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  44.61 
 
 
210 aa  158  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4573  vitamin K epoxide reductase  46.96 
 
 
197 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2394  vitamin K epoxide reductase  50.7 
 
 
223 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.334872  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2218  Vitamin K epoxide reductase  40.66 
 
 
198 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03100  predicted membrane protein  49.65 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1719  Vitamin K epoxide reductase  38.82 
 
 
241 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  42.51 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13240  predicted membrane protein  39.01 
 
 
246 aa  131  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0411  vitamin K epoxide reductase  35.06 
 
 
225 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.411434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1036  Vitamin K epoxide reductase  37.28 
 
 
247 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.45013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25470  predicted membrane protein  37.74 
 
 
258 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  0.191166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0848  Vitamin K epoxide reductase  38.26 
 
 
220 aa  99  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.040124  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0904  Vitamin K epoxide reductase  42.5 
 
 
215 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17430  predicted membrane protein  31.42 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0441  vitamin K epoxide reductase family protein  30.99 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000761314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0106  hypothetical protein  28.48 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.501997  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  26.17 
 
 
142 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  33 
 
 
325 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2930  Vitamin K epoxide reductase  34.09 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3166  Vitamin K epoxide reductase  34.09 
 
 
325 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  28.18 
 
 
125 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  27.93 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>