23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0803 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0803  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2666  Vitamin K epoxide reductase  50.41 
 
 
126 aa  134  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  32.81 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.09 
 
 
553 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0188  vitamin K epoxide reductase  31.25 
 
 
211 aa  47.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0174  vitamin K epoxide reductase  30.21 
 
 
210 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4201  vitamin K epoxide reductase  28.32 
 
 
211 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32434  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1207  Vitamin K epoxide reductase  29.59 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.825947  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25850  predicted membrane protein  31.11 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2485  Vitamin K epoxide reductase  30 
 
 
214 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0431155  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2164  vitamin K epoxide reductase  26.55 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1549  Vitamin K epoxide reductase  28.18 
 
 
212 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.558732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  29.2 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10090  predicted membrane protein  26.56 
 
 
219 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4709  Vitamin K epoxide reductase  28.12 
 
 
208 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0358404  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1760  vitamin K epoxide reductase  30.3 
 
 
130 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1922  vitamin K epoxide reductase  27.43 
 
 
218 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1942  vitamin K epoxide reductase  27.43 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4978  membrane protein-like protein  28.12 
 
 
214 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1988  vitamin K epoxide reductase  27.43 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0467  vitamin K epoxide reductase  25.22 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.055508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12983  integral membrane protein  29.47 
 
 
210 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1925  vitamin K epoxide reductase  29.51 
 
 
146 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.859119  normal  0.0200438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>