33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1469 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1469  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01721  hypothetical protein  98.72 
 
 
313 aa  624  1e-178  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156137  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01141  hypothetical protein  60.4 
 
 
316 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.450714 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02171  hypothetical protein  58.79 
 
 
313 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0354  thioredoxin domain-containing protein  58.47 
 
 
309 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2336  thioredoxin domain-containing protein  58.15 
 
 
309 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.560711  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01161  hypothetical protein  50 
 
 
311 aa  331  9e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.28971  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0105  thioredoxin domain-containing protein  49.04 
 
 
311 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01131  hypothetical protein  50 
 
 
311 aa  312  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01171  hypothetical protein  50.32 
 
 
311 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  44.04 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  38.71 
 
 
301 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  33.95 
 
 
325 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0639  thioredoxin domain-containing protein  35.15 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  0.153578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0446  vitamin K epoxide reductase  34.66 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0234  Vitamin K epoxide reductase  33.01 
 
 
310 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3166  Vitamin K epoxide reductase  33.09 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2930  Vitamin K epoxide reductase  33.09 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11661  hypothetical protein  52.94 
 
 
136 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.041891 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38289  predicted protein  28.71 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660789  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10041  hypothetical protein  51.52 
 
 
129 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0354687  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10031  hypothetical protein  51.52 
 
 
129 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48122  predicted protein  28.37 
 
 
366 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  30.48 
 
 
288 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7784  predicted protein  47.95 
 
 
79 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.980517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03861  hypothetical protein  32.77 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1458  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.291416  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1830  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.788701  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30533  predicted protein  46.15 
 
 
216 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.183112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0505  hypothetical protein  38.57 
 
 
134 aa  53.9  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.235262  normal  0.123807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  28.57 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  32.99 
 
 
151 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  24.56 
 
 
553 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>