154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1975 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1975  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1195    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1400  protein of unknown function DUF255  35.97 
 
 
628 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0823  protein of unknown function DUF255  29.81 
 
 
635 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.302169  normal  0.0427489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  31.87 
 
 
699 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  31.59 
 
 
673 aa  238  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  30.35 
 
 
718 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  29.47 
 
 
680 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  31.05 
 
 
684 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  29.86 
 
 
711 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  30.93 
 
 
718 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  30.93 
 
 
718 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  28.77 
 
 
685 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  30.43 
 
 
669 aa  226  1e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  30.89 
 
 
686 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  30.17 
 
 
667 aa  224  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  30.6 
 
 
681 aa  224  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  29.74 
 
 
687 aa  224  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0059  protein of unknown function DUF255  31.1 
 
 
634 aa  223  7e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0512308  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  35.65 
 
 
700 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  28.82 
 
 
725 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  28.93 
 
 
690 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  28.33 
 
 
733 aa  220  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  29.51 
 
 
722 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1283  hypothetical protein  31.07 
 
 
687 aa  217  5e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.960991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  33.7 
 
 
672 aa  216  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  30.11 
 
 
660 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  30.91 
 
 
665 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  31.01 
 
 
714 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  28.88 
 
 
717 aa  213  7.999999999999999e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  27.82 
 
 
700 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  26.07 
 
 
687 aa  213  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  32.16 
 
 
676 aa  213  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  28.96 
 
 
662 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  29.91 
 
 
715 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0293  protein of unknown function DUF255  30.2 
 
 
839 aa  213  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  32.71 
 
 
652 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  28.36 
 
 
705 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  30.7 
 
 
699 aa  210  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  33.33 
 
 
721 aa  210  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0712  protein of unknown function DUF255  34.41 
 
 
657 aa  210  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  30.91 
 
 
686 aa  209  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4665  Fis family transcriptional regulator  30.43 
 
 
667 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.518578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  29.46 
 
 
691 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  27.47 
 
 
665 aa  209  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  31.19 
 
 
694 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  28.44 
 
 
615 aa  208  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  33.04 
 
 
723 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  31.02 
 
 
670 aa  207  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  29.7 
 
 
751 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2586  protein of unknown function DUF255  30.8 
 
 
691 aa  207  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.248535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11102  hypothetical protein  28.94 
 
 
673 aa  207  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000180128  normal  0.240263 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  34.02 
 
 
678 aa  207  6e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  26.04 
 
 
675 aa  206  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  34.11 
 
 
700 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  28.57 
 
 
686 aa  206  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  27.86 
 
 
774 aa  206  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  28.91 
 
 
706 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  27.69 
 
 
703 aa  205  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  30.02 
 
 
664 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  30.88 
 
 
658 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  30.02 
 
 
664 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  30.81 
 
 
666 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1579  protein of unknown function DUF255  29.59 
 
 
610 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4371  hypothetical protein  29.81 
 
 
664 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  31.54 
 
 
677 aa  203  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  28.84 
 
 
720 aa  203  8e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2052  hypothetical protein  30.52 
 
 
673 aa  203  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299125  normal  0.344575 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  30.24 
 
 
676 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  31.59 
 
 
699 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  31.68 
 
 
673 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  30.12 
 
 
596 aa  201  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  27.77 
 
 
711 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  32.94 
 
 
696 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  28.11 
 
 
679 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  28.77 
 
 
707 aa  200  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  27.87 
 
 
700 aa  199  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  31.39 
 
 
680 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  29.44 
 
 
669 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  30.43 
 
 
676 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  29.96 
 
 
641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  28.75 
 
 
706 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  27.35 
 
 
746 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  27.78 
 
 
693 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  33.52 
 
 
752 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  28.54 
 
 
681 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  29.13 
 
 
699 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1409  protein of unknown function DUF255  27.37 
 
 
581 aa  196  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  28.32 
 
 
682 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  30.39 
 
 
677 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  27.94 
 
 
681 aa  195  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0897  hypothetical protein  27.21 
 
 
644 aa  194  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1171  hypothetical protein  28.95 
 
 
756 aa  193  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.872428  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  28.18 
 
 
737 aa  193  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  32.8 
 
 
673 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  29.95 
 
 
682 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  25.9 
 
 
669 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2848  hypothetical protein  31.18 
 
 
381 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  28.93 
 
 
705 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  27.94 
 
 
720 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  27.07 
 
 
750 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>