70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2735 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2735  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  28.33 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  25.56 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0192  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000685306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2622  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0102  hypothetical protein  29.79 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  33.66 
 
 		 623 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  28.3 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2274  protein of unknown function DUF255  33.57 
 
 		 552 aa  54.7  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.43 
 
 		 810 aa  53.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0491  protein of unknown function DUF255  36.05 
 
 		 549 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  35.56 
 
 		 623 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  20.34 
 
 		 270 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.52 
 
 		 610 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  35.59 
 
 		 658 aa  48.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  41.38 
 
 		 672 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  32.61 
 
 		 645 aa  47.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.73 
 
 		 628 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  32.61 
 
 		 648 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.18 
 
 		 624 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  33.33 
 
 		 608 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  32 
 
 		 610 aa  47  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.59 
 
 		 613 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.18 
 
 		 752 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.62 
 
 		 602 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1879  thioredoxin-related  28.31 
 
 		 290 aa  45.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000713848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.59 
 
 		 613 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.45 
 
 		 609 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  30.14 
 
 		 586 aa  45.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  24.75 
 
 		 130 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.05 
 
 		 616 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.05 
 
 		 616 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  30.14 
 
 		 586 aa  45.1  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  27.59 
 
 		 619 aa  44.7  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.44 
 
 		 613 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  33.71 
 
 		 718 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.58 
 
 		 586 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.48 
 
 		 600 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  28 
 
 		 611 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  34.29 
 
 		 611 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  32.58 
 
 		 682 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  32.58 
 
 		 718 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  32.58 
 
 		 718 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  26.44 
 
 		 619 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  29.76 
 
 		 357 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  28.85 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1581  protein of unknown function DUF255  30.15 
 
 		 544 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.397722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.85 
 
 		 627 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.85 
 
 		 627 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0822  Highly conserved protein containing a thioredoxin domain  22.43 
 
 		 590 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0928635  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1913  thiol:disulfide interchange protein DsbD  28.74 
 
 		 489 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00493276  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  36.51 
 
 		 725 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0486  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  27.38 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0496  hypothetical protein  21.77 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2821  hypothetical protein  26.92 
 
 		 569 aa  42  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.642839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4973  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 699 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000476148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  34.12 
 
 		 649 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  28.32 
 
 		 170 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7029  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.14 
 
 		 658 aa  41.6  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.85 
 
 		 627 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  31.82 
 
 		 680 aa  41.6  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  30.3 
 
 		 570 aa  41.6  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  25.85 
 
 		 700 aa  41.6  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  31.82 
 
 		 686 aa  41.6  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.71 
 
 		 789 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4173  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 721 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000359793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  35.38 
 
 		 750 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>