26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0102 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0102  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2622  hypothetical protein  72.37 
 
 		 152 aa  238  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0192  hypothetical protein  47.33 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000685306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3595  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3529  hypothetical protein  38 
 
 		 186 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2735  hypothetical protein  29.79 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.134896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 264 aa  45.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.35 
 
 		 304 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 312 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27.06 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 262 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  28.24 
 
 		 262 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 257 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>