More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1879 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1879  thioredoxin-related  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000713848  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.79 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0603  thioredoxin domain-containing protein  29.6 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0802586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.96 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  29.18 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  27.52 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  28.43 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  28.43 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  26.98 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  26.26 
 
 		 280 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  26.24 
 
 		 287 aa  105  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  28.1 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  28.1 
 
 		 282 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  28.11 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  27.7 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  26.92 
 
 		 286 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  26.43 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  24.55 
 
 		 287 aa  99.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  27.43 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  25.54 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  27.33 
 
 		 302 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  24.16 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  24.38 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  28.21 
 
 		 286 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  25.65 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  26.07 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  25.09 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  26.3 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  26.33 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  25.71 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  26.55 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  26.01 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  26.01 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  26.76 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  24.74 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  25.45 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  24.3 
 
 		 302 aa  92  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0577  thioredoxin domain protein  24.07 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  24.3 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0560  Thioredoxin domain protein  24.07 
 
 		 272 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.64 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  25.18 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  26.76 
 
 		 289 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  24.65 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  24.48 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  23.84 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  26.24 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  22.3 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  23.24 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  23.93 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  26.81 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  26.91 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  25.96 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  24.46 
 
 		 314 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  24.31 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  25.41 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  21.85 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2864  thioredoxin domain-containing protein  27.02 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.499317  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  25.98 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  24.43 
 
 		 326 aa  85.9  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  24.16 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  23.57 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  26.37 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  22.68 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  26.55 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5272  Thioredoxin domain protein  25.93 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.127007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  27.04 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  27.04 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  27.04 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  27.04 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  27.04 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0364  thioredoxin domain-containing protein  24.34 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000110184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  22.48 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  23.48 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  25.81 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  25.81 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  23.08 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3864  thioredoxin domain-containing protein  24.74 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  25.81 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  25.81 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  25.81 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  23.78 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  25.09 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  26.67 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  26.67 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  21.99 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  24.3 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  26.95 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  21.35 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  25 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  25 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  25 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  26.07 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  25.27 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  25.52 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  24.01 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  21.11 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  22.3 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>