28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0190 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0190  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  416  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2160  hypothetical protein  37.82 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0111  hypothetical protein  28.86 
 
 
178 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  27.03 
 
 
160 aa  55.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0030  hypothetical protein  25.41 
 
 
169 aa  55.5  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0285  hypothetical protein  24.39 
 
 
177 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  25.35 
 
 
531 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  25.35 
 
 
556 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  25.55 
 
 
576 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0813  thioredoxin  27.27 
 
 
109 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146615  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  26.39 
 
 
534 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  25.71 
 
 
566 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  25.71 
 
 
531 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  30.21 
 
 
107 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  25.44 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  25.24 
 
 
522 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0756  thioredoxin  28.42 
 
 
101 aa  42.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  24.83 
 
 
522 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  24.83 
 
 
522 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  24.83 
 
 
522 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  24.83 
 
 
522 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  24.83 
 
 
522 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  25.24 
 
 
168 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  24.83 
 
 
522 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  25.71 
 
 
531 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0234  hypothetical protein  21.88 
 
 
165 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.889032  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  29.17 
 
 
106 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.1 
 
 
485 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>