78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3976 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3976  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  994    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4014  hypothetical protein  34.97 
 
 		 376 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0409  tetratricopeptide TPR_4  32.8 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.104079  normal  0.295329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4156  hypothetical protein  33.68 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4130  hypothetical protein  33.68 
 
 		 376 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0603  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.33 
 
 		 672 aa  57.4  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.827983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  32.93 
 
 		 529 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  28.79 
 
 		 566 aa  54.7  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 		 531 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0388  Thioredoxin domain protein  26.32 
 
 		 466 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.848154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  28.79 
 
 		 531 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 		 534 aa  53.9  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  29.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  29.82 
 
 		 556 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  28.95 
 
 		 522 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  28.95 
 
 		 522 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  29.46 
 
 		 522 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  37.5 
 
 		 697 aa  51.6  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  28.46 
 
 		 576 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  23.85 
 
 		 270 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.17 
 
 		 810 aa  51.2  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3474  thiol:disulfide interchange protein  47.37 
 
 		 558 aa  50.1  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149531  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  25.81 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  32.59 
 
 		 144 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2281  Thioredoxin domain  32.22 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.38 
 
 		 602 aa  48.5  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2780  thioredoxin-related protein-like protein  29.49 
 
 		 391 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0175859  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  28.4 
 
 		 315 aa  48.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7116  thioredoxin domain protein  30.77 
 
 		 161 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0591  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region/thioredoxin-related  34.04 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.945166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.07 
 
 		 606 aa  47.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  29.23 
 
 		 625 aa  47.4  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  24.89 
 
 		 305 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0636  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.47 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.619274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2382  Protein-disulfide reductase  30.59 
 
 		 581 aa  46.6  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  7.870920000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1636  Thiol:disulfide interchange protein-like protein  29.27 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.94 
 
 		 607 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  30 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  31.11 
 
 		 280 aa  46.2  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  37.31 
 
 		 628 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.92 
 
 		 611 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.39 
 
 		 281 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0588  hypothetical protein  28.07 
 
 		 692 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.155052  normal  0.0633893 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  36.99 
 
 		 600 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  30.36 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  26.85 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  29.36 
 
 		 280 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.79 
 
 		 608 aa  44.3  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0217  protein of unknown function DUF255  34.18 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  32.58 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  32.58 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  30.11 
 
 		 302 aa  44.3  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  31.46 
 
 		 282 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  29.81 
 
 		 281 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1204  hypothetical protein  29.6 
 
 		 661 aa  43.9  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.139299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6051  thioredoxin domain protein  29.07 
 
 		 148 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0119737  normal  0.502924 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  28.72 
 
 		 406 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  26.24 
 
 		 586 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.9 
 
 		 586 aa  43.5  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  29.03 
 
 		 287 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  34.25 
 
 		 603 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  30.11 
 
 		 302 aa  43.5  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3953  Thioredoxin domain  24.53 
 
 		 162 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 609 aa  43.9  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  31.46 
 
 		 282 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  30.1 
 
 		 149 aa  43.5  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.93 
 
 		 616 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.93 
 
 		 616 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  26.24 
 
 		 586 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2613  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  30.16 
 
 		 421 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  31.46 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  31.11 
 
 		 144 aa  43.5  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  27.27 
 
 		 918 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  31.46 
 
 		 282 aa  43.5  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>