15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0166 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  716    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  38.39 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  32.5 
 
 
149 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  36.47 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  28.46 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  25.53 
 
 
314 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  35.42 
 
 
147 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  28.18 
 
 
144 aa  63.5  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  30 
 
 
339 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  33.02 
 
 
144 aa  57  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  26.53 
 
 
142 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  24.09 
 
 
167 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  28.97 
 
 
146 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  26.26 
 
 
174 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>