24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08091 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08091  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3757  hypothetical protein  42.06 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.639836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1875  hypothetical protein  40.37 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0842968  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5766  hypothetical protein  33.57 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1841  Thioredoxin domain  33.59 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.928879  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0147  Thioredoxin domain  35.14 
 
 
321 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1422  hypothetical protein  34.34 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501791  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4466  hypothetical protein  32.84 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0166  hypothetical protein  28.18 
 
 
350 aa  63.5  0.0000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0134966  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1598  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  60.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_002620  TC0161  hypothetical protein  30.08 
 
 
165 aa  58.2  0.00000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00228251  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3686  restriction endonuclease  30.19 
 
 
421 aa  57  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0805  Thioredoxin domain protein  24.81 
 
 
270 aa  47.4  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2057  hypothetical protein  30.19 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1456  peptidylprolyl isomerase, FKBP-type  26.42 
 
 
406 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1484  hypothetical protein  25.74 
 
 
339 aa  44.7  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0806  protein of unknown function DUF255  25.58 
 
 
274 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.862822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  34.55 
 
 
529 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1900  hypothetical protein  25.36 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0117  putative lipoprotein  31.67 
 
 
304 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0852  hypothetical protein  40.74 
 
 
190 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.87 
 
 
616 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2038  Thioredoxin domain protein  25.24 
 
 
357 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.571694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.18 
 
 
604 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>