12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0623 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  778    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.907452  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1798  hypothetical protein  31.58 
 
 		 384 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1830  hypothetical protein  35.78 
 
 		 383 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1489  hypothetical protein  27.18 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0644  hypothetical protein  27.62 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00156729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004005  hypothetical protein  37.09 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01517  hypothetical protein  36.42 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0978  hypothetical protein  26.24 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3987  hypothetical protein  31.58 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0032  hypothetical protein  26.44 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1806  hypothetical protein  25.77 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0032  hypothetical protein  28 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.65464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>