12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1798 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1798  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  784    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1830  hypothetical protein  29.24 
 
 
383 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01517  hypothetical protein  30.26 
 
 
386 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1489  hypothetical protein  28.8 
 
 
383 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004005  hypothetical protein  30.05 
 
 
386 aa  140  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0623  hypothetical protein  31.58 
 
 
385 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.907452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0644  hypothetical protein  25.78 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00156729  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0978  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4198  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.168052  normal  0.0218425 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0694  hypothetical protein  26.85 
 
 
284 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1806  hypothetical protein  23.6 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3272  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.51 
 
 
654 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>