17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3051 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  64.04 
 
 		 289 aa  344  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  47.23 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  39.85 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  42.04 
 
 		 232 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  35.77 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0567  hypothetical protein  39.71 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  39.81 
 
 		 109 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3054  hypothetical protein  41.18 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  30.41 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  32.17 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  32.97 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  45.65 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.91 
 
 		 355 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5329  hypothetical protein  38.71 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>