15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1627 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  610  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  48.66 
 
 		 232 aa  222  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  41.92 
 
 		 289 aa  221  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  40.4 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  39.85 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  47.52 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0567  hypothetical protein  38.97 
 
 		 351 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  34.78 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3054  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  34.65 
 
 		 109 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  29.29 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  29.7 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1271  hypothetical protein  46.55 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  37.68 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5329  hypothetical protein  47.83 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>