12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2222 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  63.46 
 
 
109 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  38.62 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  27.55 
 
 
321 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0567  hypothetical protein  39.42 
 
 
351 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  36.23 
 
 
319 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  34.78 
 
 
294 aa  89  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  27.95 
 
 
289 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 
267 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  28.64 
 
 
232 aa  85.5  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  23.45 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3054  hypothetical protein  30 
 
 
90 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>