15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3210 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  649    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  47.44 
 
 
319 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  27.55 
 
 
311 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1682  hypothetical protein  46.24 
 
 
119 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1615  hypothetical protein  44.09 
 
 
103 aa  89.4  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  31.2 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  32.17 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1683  hypothetical protein  35.29 
 
 
83 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.396672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1616  hypothetical protein  35.29 
 
 
83 aa  60.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  26.25 
 
 
289 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  25.64 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  34.58 
 
 
109 aa  57  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4262  hypothetical protein  35.71 
 
 
183 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.898405  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  28.71 
 
 
232 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  29.7 
 
 
294 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>