13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4789 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4789  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1627  hypothetical protein  48.66 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1798  hypothetical protein  44.69 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3051  hypothetical protein  42.04 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3694  hypothetical protein  41.99 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000233767 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2312  hypothetical protein  41.76 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000231336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0567  hypothetical protein  36.3 
 
 		 351 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.547541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2222  hypothetical protein  28.64 
 
 		 311 aa  85.5  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00344567  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1697  hypothetical protein  35.35 
 
 		 109 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000463724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3054  hypothetical protein  41.67 
 
 		 90 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0440  hypothetical protein  27.52 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000177301  hitchhiker  0.000000000000366225 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3210  hypothetical protein  28.71 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0244916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  23.75 
 
 		 293 aa  42.7  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>