18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1589 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  100 
 
 
300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  83.96 
 
 
312 aa  521  1e-147  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  52.23 
 
 
333 aa  300  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  42.72 
 
 
320 aa  252  7e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  38.11 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  37.9 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  37.22 
 
 
308 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  31.75 
 
 
312 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  33.79 
 
 
315 aa  107  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  30.63 
 
 
311 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  31.98 
 
 
316 aa  96.7  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  33.85 
 
 
316 aa  95.5  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  31.63 
 
 
105 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  29.66 
 
 
201 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1993  hypothetical protein  24.34 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.134183  normal  0.214842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  39.74 
 
 
345 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  38.46 
 
 
374 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1301  hypothetical protein  26.4 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>