17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0886 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  652    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  66.45 
 
 		 316 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  66.77 
 
 		 316 aa  433  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  45.16 
 
 		 312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  43.46 
 
 		 311 aa  245  8e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  36.91 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  41.9 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  37.91 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  35.27 
 
 		 312 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  38.14 
 
 		 201 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  57.69 
 
 		 105 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  35.14 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  33.79 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  36.13 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  60.87 
 
 		 70 aa  95.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0273  hypothetical protein  70.21 
 
 		 49 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4740  hypothetical protein  28 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.107492  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>