14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1748 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  100 
 
 
319 aa  642    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  39.1 
 
 
320 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  38.39 
 
 
312 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  39.73 
 
 
308 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  39.62 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  37.9 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  36.51 
 
 
333 aa  170  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  37.19 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  32 
 
 
316 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  32 
 
 
316 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  36.13 
 
 
315 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  32.21 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  33.9 
 
 
70 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.101618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>