15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0005 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  100 
 
 		 333 aa  667    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  54.49 
 
 		 312 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  52 
 
 		 300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  43.73 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  40.12 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  39.75 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  36.53 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  36.13 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  31.6 
 
 		 316 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  36.46 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  31.2 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  35.14 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  44.12 
 
 		 105 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4242  hypothetical protein  32.93 
 
 		 201 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  42.11 
 
 		 70 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>