95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05390 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  719    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  46.75 
 
 
772 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  41.62 
 
 
842 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  35.19 
 
 
659 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  35.5 
 
 
656 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  34.13 
 
 
656 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.82 
 
 
700 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  28.82 
 
 
687 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  34.14 
 
 
690 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  30.95 
 
 
722 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  29.02 
 
 
695 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.12 
 
 
699 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  33.2 
 
 
707 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  29.6 
 
 
697 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  29.48 
 
 
697 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  27.68 
 
 
689 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  32.67 
 
 
692 aa  119  9e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
785 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.7 
 
 
641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  31.33 
 
 
704 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.24 
 
 
631 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  31.05 
 
 
629 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  28.33 
 
 
559 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.23 
 
 
726 aa  102  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.05 
 
 
699 aa  100  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  27.52 
 
 
669 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  30.04 
 
 
539 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  31.48 
 
 
695 aa  93.6  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  34 
 
 
552 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  31.52 
 
 
621 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  24.01 
 
 
578 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.57 
 
 
555 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  28.26 
 
 
585 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  32 
 
 
609 aa  89.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  25.32 
 
 
582 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  27.66 
 
 
573 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  31.15 
 
 
590 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  28.81 
 
 
571 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  26.15 
 
 
573 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  29.61 
 
 
552 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  27.9 
 
 
600 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  26.42 
 
 
656 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  26.98 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  24.58 
 
 
696 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  28.06 
 
 
555 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  30.91 
 
 
526 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.69 
 
 
591 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  29.37 
 
 
573 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  27.62 
 
 
569 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  26.46 
 
 
596 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  24.2 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23.03 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  23.03 
 
 
584 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  27.75 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  39.25 
 
 
172 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  25.1 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  25.1 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  23.75 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.67 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  25.82 
 
 
619 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  27.14 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  23.51 
 
 
593 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  29.95 
 
 
201 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  27.93 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  20.73 
 
 
568 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  29.29 
 
 
574 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  24.81 
 
 
606 aa  65.9  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  25.94 
 
 
689 aa  63.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  25.57 
 
 
723 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  25.42 
 
 
649 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  35.96 
 
 
573 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  32.22 
 
 
588 aa  59.7  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  21.4 
 
 
646 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.44 
 
 
600 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  26.09 
 
 
680 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  38.24 
 
 
165 aa  56.2  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  33.33 
 
 
709 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  23.35 
 
 
663 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  22.75 
 
 
664 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  31.43 
 
 
223 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  27.21 
 
 
612 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  26.81 
 
 
619 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  22.71 
 
 
490 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  32.97 
 
 
780 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  34.04 
 
 
322 aa  50.1  0.00006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  33.68 
 
 
779 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  33.68 
 
 
779 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  38.16 
 
 
593 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  26.57 
 
 
458 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  35.79 
 
 
615 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  22.87 
 
 
451 aa  46.6  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  32.53 
 
 
470 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  34.21 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  19.76 
 
 
835 aa  43.5  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  26.79 
 
 
432 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>