56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2088 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1597    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8679  hypothetical protein  27.16 
 
 		 816 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  23.24 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  23.24 
 
 		 779 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  31.19 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.78 
 
 		 772 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  26.52 
 
 		 529 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.13 
 
 		 689 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  34.92 
 
 		 687 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  34.69 
 
 		 573 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  28.37 
 
 		 590 aa  55.1  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  33.7 
 
 		 704 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  29.2 
 
 		 552 aa  54.3  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  32.58 
 
 		 552 aa  53.5  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  31.82 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  36.78 
 
 		 562 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  34.48 
 
 		 722 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  30.51 
 
 		 606 aa  52.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  33.68 
 
 		 596 aa  52.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  36.78 
 
 		 562 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  34.07 
 
 		 649 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  29.22 
 
 		 602 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  28.16 
 
 		 600 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  31.73 
 
 		 659 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  29.9 
 
 		 842 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  32.97 
 
 		 353 aa  50.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  29.7 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.77 
 
 		 699 aa  50.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  35.87 
 
 		 707 aa  50.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  30.48 
 
 		 563 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  31.53 
 
 		 697 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  31.53 
 
 		 697 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.28 
 
 		 699 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  24.63 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  30.63 
 
 		 573 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  30.61 
 
 		 172 aa  48.1  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 695 aa  48.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  30.28 
 
 		 458 aa  47.8  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  33.33 
 
 		 451 aa  47.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  32.29 
 
 		 550 aa  47.8  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  29.03 
 
 		 591 aa  47.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  26.85 
 
 		 619 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  28 
 
 		 692 aa  45.8  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  32.22 
 
 		 555 aa  45.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  28.12 
 
 		 580 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  26.92 
 
 		 465 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  26.92 
 
 		 465 aa  45.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  26.79 
 
 		 582 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  30.95 
 
 		 689 aa  44.3  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  21.67 
 
 		 584 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  30.89 
 
 		 577 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  21.67 
 
 		 584 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  30 
 
 		 621 aa  43.9  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  31.52 
 
 		 664 aa  44.3  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>