50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8679 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8679  hypothetical protein  100 
 
 		 816 aa  1673    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  28.95 
 
 		 780 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  28.01 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  28.01 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  34.82 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  34.55 
 
 		 687 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  30.28 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  30.82 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  37.08 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  37.08 
 
 		 562 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.99 
 
 		 591 aa  54.7  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  31.19 
 
 		 573 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  28.57 
 
 		 600 aa  52.8  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  34.94 
 
 		 499 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  27.52 
 
 		 550 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  30.48 
 
 		 563 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  31.19 
 
 		 571 aa  52  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  28.46 
 
 		 584 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  28.46 
 
 		 584 aa  51.6  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  28.85 
 
 		 573 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  28.85 
 
 		 573 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  31.19 
 
 		 723 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  22.22 
 
 		 689 aa  50.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  30.93 
 
 		 709 aa  49.7  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  29.25 
 
 		 582 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  34.57 
 
 		 593 aa  47.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  32.65 
 
 		 552 aa  47.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  34.09 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  32.56 
 
 		 615 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  28.57 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  30 
 
 		 606 aa  47  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  33.7 
 
 		 498 aa  47  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  31.52 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  31.31 
 
 		 596 aa  47  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  29.59 
 
 		 585 aa  45.8  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  37.97 
 
 		 580 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  29.21 
 
 		 842 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  34.12 
 
 		 649 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  28.89 
 
 		 577 aa  45.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  33.72 
 
 		 471 aa  45.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  32.71 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  34.29 
 
 		 705 aa  45.4  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  32.32 
 
 		 172 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  29.52 
 
 		 569 aa  45.1  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  28.21 
 
 		 599 aa  45.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  30 
 
 		 322 aa  44.7  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  29.91 
 
 		 555 aa  44.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.48 
 
 		 699 aa  44.3  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  29.03 
 
 		 559 aa  44.3  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>