60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1183 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1601    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  100 
 
 		 779 aa  1601    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  23.24 
 
 		 780 aa  137  8e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8679  hypothetical protein  28.01 
 
 		 816 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  34.69 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  35.8 
 
 		 689 aa  54.7  0.000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  30.3 
 
 		 680 aa  54.3  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  37 
 
 		 596 aa  54.3  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  35.63 
 
 		 723 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  28.99 
 
 		 687 aa  53.5  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  35.96 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 573 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  30.48 
 
 		 471 aa  52.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  33.71 
 
 		 584 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  33.71 
 
 		 584 aa  52.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  34.41 
 
 		 539 aa  51.6  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  33.63 
 
 		 600 aa  51.6  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  40.86 
 
 		 722 aa  52  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  32.53 
 
 		 563 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.75 
 
 		 726 aa  51.6  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  26.15 
 
 		 552 aa  51.2  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  35.56 
 
 		 772 aa  50.8  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  34.88 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  28.57 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  27.37 
 
 		 690 aa  50.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  32.04 
 
 		 569 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  33.68 
 
 		 353 aa  49.7  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  31.31 
 
 		 695 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  31.85 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  32.18 
 
 		 550 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  34.78 
 
 		 172 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  21.72 
 
 		 458 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  28.24 
 
 		 591 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  30.61 
 
 		 585 aa  48.5  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  32.58 
 
 		 689 aa  48.5  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  38.55 
 
 		 699 aa  48.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  33.68 
 
 		 600 aa  48.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  33.1 
 
 		 649 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  32.56 
 
 		 470 aa  48.1  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  34.48 
 
 		 529 aa  47.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  32.08 
 
 		 664 aa  47.8  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  32.94 
 
 		 559 aa  47.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  34.44 
 
 		 619 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  33.7 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  31.4 
 
 		 573 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  27.07 
 
 		 593 aa  47.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  30.23 
 
 		 573 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  31.11 
 
 		 842 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  35.63 
 
 		 432 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  27.56 
 
 		 602 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  37.61 
 
 		 695 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  31.43 
 
 		 562 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  29.81 
 
 		 697 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  29.81 
 
 		 697 aa  46.2  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  31.43 
 
 		 562 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  27.21 
 
 		 498 aa  45.8  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.42 
 
 		 700 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  34.48 
 
 		 709 aa  45.4  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  32.53 
 
 		 704 aa  44.3  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  32.22 
 
 		 707 aa  44.3  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>