52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00127 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1489    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  39 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  40.79 
 
 		 664 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  39.47 
 
 		 663 aa  60.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  37.68 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  43.48 
 
 		 646 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  39.53 
 
 		 649 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  47.37 
 
 		 491 aa  56.6  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  45.9 
 
 		 689 aa  55.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  35.9 
 
 		 539 aa  55.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  40 
 
 		 559 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  36.36 
 
 		 584 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  36.36 
 
 		 584 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  32.89 
 
 		 470 aa  54.7  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  36.62 
 
 		 499 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  35.71 
 
 		 585 aa  54.3  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  36.84 
 
 		 600 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  35.21 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  37.88 
 
 		 552 aa  52  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  31.58 
 
 		 471 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  34.67 
 
 		 615 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  43.24 
 
 		 656 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  38.75 
 
 		 172 aa  50.8  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  37.5 
 
 		 529 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  39.08 
 
 		 659 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  42.86 
 
 		 593 aa  50.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  37.18 
 
 		 709 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  40.3 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  38.71 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  31.48 
 
 		 498 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  35.06 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  38.71 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  24.55 
 
 		 780 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  28.19 
 
 		 680 aa  48.9  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  37.97 
 
 		 842 aa  48.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  34.33 
 
 		 552 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  33.82 
 
 		 593 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  30.95 
 
 		 591 aa  47.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  37.5 
 
 		 223 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  37.36 
 
 		 588 aa  47  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  34.78 
 
 		 458 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  39.44 
 
 		 656 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  42.03 
 
 		 723 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  32.91 
 
 		 546 aa  45.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.41 
 
 		 555 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  32.88 
 
 		 582 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.29 
 
 		 641 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  38.36 
 
 		 561 aa  44.3  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 689 aa  44.3  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  29.06 
 
 		 548 aa  44.3  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  24.4 
 
 		 656 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>