64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1377 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1036    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  37.15 
 
 
491 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  31.64 
 
 
432 aa  200  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  23.4 
 
 
451 aa  92.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  23.62 
 
 
499 aa  84.7  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  23.46 
 
 
470 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  23.57 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  26.13 
 
 
842 aa  70.5  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  28.4 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  26.64 
 
 
562 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  27.95 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  27.95 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  27.35 
 
 
689 aa  64.3  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  30.48 
 
 
458 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  26.64 
 
 
562 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  25.59 
 
 
539 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  26.05 
 
 
529 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  25.83 
 
 
600 aa  58.5  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  25.57 
 
 
585 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  23.16 
 
 
591 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  30.34 
 
 
563 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.53 
 
 
550 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 
555 aa  55.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  26.07 
 
 
680 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  26.32 
 
 
723 aa  54.7  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  27.19 
 
 
687 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.09 
 
 
699 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  25.45 
 
 
606 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  35.63 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.91 
 
 
726 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  25.54 
 
 
552 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  24.31 
 
 
577 aa  51.6  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  26.34 
 
 
697 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  26.34 
 
 
697 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25.76 
 
 
593 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  26.11 
 
 
649 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  26.12 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  31.48 
 
 
722 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  24.56 
 
 
559 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  35.9 
 
 
664 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  35.9 
 
 
663 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  29.01 
 
 
704 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.39 
 
 
596 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  23.87 
 
 
695 aa  47.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  23.39 
 
 
561 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  33.33 
 
 
573 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  39.02 
 
 
646 aa  47.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  24.9 
 
 
722 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  25.26 
 
 
835 aa  47  0.0008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  26.05 
 
 
709 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  24.7 
 
 
600 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  37.8 
 
 
82 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  26.13 
 
 
707 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.64 
 
 
641 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  32.04 
 
 
695 aa  45.8  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  27.21 
 
 
779 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.76 
 
 
631 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  27.21 
 
 
779 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  30.08 
 
 
601 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  28 
 
 
609 aa  44.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  23.49 
 
 
689 aa  44.3  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  36.78 
 
 
699 aa  43.9  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  31.33 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  31.33 
 
 
465 aa  43.5  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>