63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0248 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1271    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  26.08 
 
 		 602 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  24.16 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  24.05 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0809  hypothetical protein  22.71 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  30.04 
 
 		 646 aa  73.9  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  26.38 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  25.51 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  40.23 
 
 		 591 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  41.25 
 
 		 573 aa  56.2  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  30.07 
 
 		 680 aa  55.1  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  45.68 
 
 		 555 aa  54.7  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.54 
 
 		 600 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  40.79 
 
 		 689 aa  53.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  39.08 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  24.39 
 
 		 709 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  37.37 
 
 		 593 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  40.51 
 
 		 723 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  40.74 
 
 		 550 aa  52  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  23.58 
 
 		 649 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  38.27 
 
 		 539 aa  51.6  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  38.55 
 
 		 596 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  34.67 
 
 		 722 aa  51.2  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.27 
 
 		 573 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 590 aa  50.1  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  37.84 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  29.57 
 
 		 499 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  36 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  27.64 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  41.03 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  36.05 
 
 		 172 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  41.03 
 
 		 465 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  26.47 
 
 		 584 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  26.47 
 
 		 584 aa  48.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.86 
 
 		 699 aa  48.1  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  23.95 
 
 		 663 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  22.88 
 
 		 593 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  25 
 
 		 687 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  35.79 
 
 		 353 aa  47.4  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  39.36 
 
 		 697 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  39.36 
 
 		 697 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  37.33 
 
 		 835 aa  47  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  24.15 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  32.43 
 
 		 568 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  32.93 
 
 		 322 aa  46.2  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  35.35 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  23.95 
 
 		 664 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  24.15 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  34.04 
 
 		 707 aa  45.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  34.52 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  39.02 
 
 		 562 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  39.02 
 
 		 562 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  25.7 
 
 		 582 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  20.92 
 
 		 571 aa  44.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  35.87 
 
 		 722 aa  44.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0808  hypothetical protein  29.41 
 
 		 809 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  28.71 
 
 		 458 aa  44.3  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  32.69 
 
 		 561 aa  43.9  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  31.58 
 
 		 600 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  37.21 
 
 		 699 aa  43.9  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  26.8 
 
 		 588 aa  43.9  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  24.9 
 
 		 569 aa  43.9  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>