85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1785 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  955    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  52.97 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  52.33 
 
 		 471 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  32.5 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  30.42 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  27.78 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  24.26 
 
 		 646 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  23.92 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 		 529 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  41.98 
 
 		 555 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  39.08 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  24.21 
 
 		 649 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  30.48 
 
 		 498 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  24.08 
 
 		 723 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  44.62 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  44.62 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  40.62 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  40.62 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.22 
 
 		 842 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  40.51 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  41.43 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  40.24 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  33.83 
 
 		 591 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  23.25 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  42.65 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  42.19 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  36.99 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  26.43 
 
 		 687 aa  57  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  39.39 
 
 		 550 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  36 
 
 		 573 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  35.71 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  40.3 
 
 		 593 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  37.31 
 
 		 619 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  35.06 
 
 		 600 aa  55.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  40.98 
 
 		 82 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  35.21 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  36 
 
 		 571 aa  53.9  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  26.42 
 
 		 600 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  32.93 
 
 		 569 aa  53.9  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  37.97 
 
 		 590 aa  53.5  0.000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  36.25 
 
 		 709 aa  53.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  34.38 
 
 		 559 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  35.16 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  38.67 
 
 		 690 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  22.71 
 
 		 664 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  34.29 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  27.5 
 
 		 689 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  37.66 
 
 		 490 aa  51.6  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  40 
 
 		 552 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  34.52 
 
 		 606 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.27 
 
 		 772 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  37.31 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  36.25 
 
 		 695 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  21.72 
 
 		 779 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  21.72 
 
 		 779 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  35.82 
 
 		 172 aa  48.5  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  26.57 
 
 		 353 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  34.09 
 
 		 692 aa  47.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  30.28 
 
 		 780 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.57 
 
 		 555 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  36.23 
 
 		 578 aa  47  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 		 785 aa  47  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  34.78 
 
 		 722 aa  46.6  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  32.84 
 
 		 552 aa  46.6  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  29.63 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  33.33 
 
 		 697 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 697 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  36.14 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  33.33 
 
 		 753 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  33.33 
 
 		 704 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  28.47 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  32.35 
 
 		 568 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.93 
 
 		 631 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  28.71 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  30.67 
 
 		 619 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0247  hypothetical protein  27.74 
 
 		 714 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  34.18 
 
 		 707 aa  43.9  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  31.51 
 
 		 722 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.86 
 
 		 700 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.91 
 
 		 699 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  28.04 
 
 		 596 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  21.57 
 
 		 656 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>