65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2212 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  98.75 
 
 		 432 aa  168  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  48.65 
 
 		 539 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  44.16 
 
 		 550 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  49.18 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  49.18 
 
 		 562 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  40.26 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  42.42 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  36.23 
 
 		 529 aa  57.4  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  38.96 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  42.19 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  43.75 
 
 		 593 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  45.9 
 
 		 573 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  40.98 
 
 		 458 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  41.67 
 
 		 491 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  37.1 
 
 		 563 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  37.5 
 
 		 619 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  33.71 
 
 		 585 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  39.06 
 
 		 649 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  41.1 
 
 		 646 aa  51.2  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  41.03 
 
 		 451 aa  50.8  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  42.62 
 
 		 555 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  37.1 
 
 		 559 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  38.1 
 
 		 465 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  38.1 
 
 		 465 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  37.8 
 
 		 590 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  34.43 
 
 		 692 aa  49.3  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  36.67 
 
 		 573 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  34.78 
 
 		 690 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  36.67 
 
 		 573 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  36.84 
 
 		 588 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  35.59 
 
 		 568 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 593 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  32.1 
 
 		 602 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  40 
 
 		 571 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  37.8 
 
 		 498 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.17 
 
 		 689 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  35.38 
 
 		 664 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  35.38 
 
 		 663 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  35.71 
 
 		 582 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  38.98 
 
 		 680 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  39.73 
 
 		 695 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  37.7 
 
 		 569 aa  43.9  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  33.87 
 
 		 689 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  34.62 
 
 		 591 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  32.43 
 
 		 564 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  38.98 
 
 		 578 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  37.5 
 
 		 723 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  36.36 
 
 		 779 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  34.72 
 
 		 709 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  36.36 
 
 		 779 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  32.47 
 
 		 573 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  36.07 
 
 		 552 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  30.61 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  30.61 
 
 		 584 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.87 
 
 		 555 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  32.43 
 
 		 601 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  36.62 
 
 		 577 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  34.29 
 
 		 697 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 656 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  34.85 
 
 		 615 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  34.29 
 
 		 697 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  35.71 
 
 		 574 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  34.29 
 
 		 699 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  32.86 
 
 		 704 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>