85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0357 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  100 
 
 		 785 aa  1585    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.66 
 
 		 641 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.33 
 
 		 631 aa  272  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  30.89 
 
 		 621 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  35.15 
 
 		 695 aa  259  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.19 
 
 		 726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  31.31 
 
 		 629 aa  232  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  30.38 
 
 		 669 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  27.9 
 
 		 696 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  29.2 
 
 		 609 aa  204  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  29.37 
 
 		 656 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.93 
 
 		 772 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  29.29 
 
 		 842 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  24.42 
 
 		 659 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.49 
 
 		 656 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  25.56 
 
 		 656 aa  148  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  26.94 
 
 		 695 aa  147  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  27.3 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  27.3 
 
 		 697 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.23 
 
 		 699 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  29.45 
 
 		 700 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  26.83 
 
 		 704 aa  124  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.71 
 
 		 699 aa  123  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  24.13 
 
 		 690 aa  120  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  24.84 
 
 		 722 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  33.45 
 
 		 590 aa  110  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  26.71 
 
 		 707 aa  110  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  21.17 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  23.34 
 
 		 687 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  24.18 
 
 		 692 aa  100  9e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  27.06 
 
 		 582 aa  98.6  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  28.29 
 
 		 600 aa  91.3  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  29.46 
 
 		 529 aa  88.6  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  32.5 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  30.38 
 
 		 559 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.95 
 
 		 591 aa  78.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  25.68 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  30.43 
 
 		 552 aa  76.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.42 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  27.21 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.14 
 
 		 526 aa  73.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  26.79 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  26.79 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  24.11 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  25.51 
 
 		 573 aa  70.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  26.87 
 
 		 573 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.14 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  27.38 
 
 		 574 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  22.97 
 
 		 584 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  22.97 
 
 		 584 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  25.93 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  26.72 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  29.9 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.6 
 
 		 550 aa  62.4  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.7 
 
 		 562 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  22.76 
 
 		 490 aa  62  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  24.7 
 
 		 562 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  27.57 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  21.94 
 
 		 552 aa  61.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  25 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  23.88 
 
 		 563 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  22.84 
 
 		 593 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  26.38 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  23.29 
 
 		 539 aa  57  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  19.92 
 
 		 835 aa  54.7  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  28.51 
 
 		 689 aa  54.7  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.63 
 
 		 600 aa  54.3  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  28.21 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  26.43 
 
 		 649 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  35.21 
 
 		 165 aa  52.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  30.77 
 
 		 499 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  21.66 
 
 		 723 aa  48.9  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  48.5  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  24.85 
 
 		 564 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 593 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0503  hypothetical protein  30.85 
 
 		 277 aa  47.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  30.84 
 
 		 580 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 458 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  24.48 
 
 		 588 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  25.88 
 
 		 619 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  20.53 
 
 		 646 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  22.27 
 
 		 606 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  24.19 
 
 		 491 aa  44.7  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  20.08 
 
 		 680 aa  44.3  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>