17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0247 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0247  hypothetical protein  100 
 
 
714 aa  1474    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1352  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 
727 aa  67.4  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000170725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2196  hypothetical protein  25 
 
 
744 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2693  hypothetical protein  24.09 
 
 
848 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.145629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  24.21 
 
 
591 aa  54.7  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  23.24 
 
 
689 aa  54.7  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  25.71 
 
 
562 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.61 
 
 
562 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.36 
 
 
585 aa  52  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  25.18 
 
 
603 aa  48.9  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  32.69 
 
 
499 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  21.27 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  22.5 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  32.38 
 
 
575 aa  44.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  22.03 
 
 
584 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  22.03 
 
 
584 aa  44.3  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  27.74 
 
 
458 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>