96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1333 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
722 aa  1493    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  50.54 
 
 
699 aa  538  9.999999999999999e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  49.49 
 
 
707 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  48.32 
 
 
704 aa  535  1e-150  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  49.73 
 
 
697 aa  535  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  49.91 
 
 
697 aa  533  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  48.57 
 
 
699 aa  535  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  47.25 
 
 
695 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  34.65 
 
 
687 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  34.75 
 
 
656 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  32.46 
 
 
692 aa  303  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  33.33 
 
 
690 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  35.09 
 
 
659 aa  283  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  33.16 
 
 
689 aa  272  1e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  32.69 
 
 
656 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  33.1 
 
 
842 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1334  hypothetical protein  63.03 
 
 
378 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  30.78 
 
 
772 aa  226  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.04 
 
 
700 aa  207  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.33 
 
 
631 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.96 
 
 
573 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  27.63 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.56 
 
 
573 aa  135  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
600 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  30.95 
 
 
353 aa  131  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  24.27 
 
 
609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  24.18 
 
 
569 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  27.45 
 
 
695 aa  128  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  25.55 
 
 
621 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  26.17 
 
 
696 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.56 
 
 
726 aa  126  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  25.57 
 
 
552 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.89 
 
 
641 aa  117  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  25.38 
 
 
785 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  24.87 
 
 
539 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  22.75 
 
 
559 aa  114  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.44 
 
 
550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  24.57 
 
 
571 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  29.98 
 
 
656 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  24.92 
 
 
574 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  23.46 
 
 
669 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0620  hypothetical protein  35.66 
 
 
382 aa  104  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.500852  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  25.12 
 
 
629 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 
526 aa  103  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  22.66 
 
 
561 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  22.49 
 
 
578 aa  91.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.71 
 
 
562 aa  91.3  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  28.71 
 
 
596 aa  90.9  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.55 
 
 
555 aa  90.9  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  23.54 
 
 
562 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  23.93 
 
 
555 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  23.5 
 
 
619 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  23.2 
 
 
552 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  24.09 
 
 
573 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  22.83 
 
 
568 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  21.18 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  28.86 
 
 
563 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.71 
 
 
585 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1611  hypothetical protein  28.08 
 
 
392 aa  75.1  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.88 
 
 
600 aa  74.7  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  23.75 
 
 
584 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23.75 
 
 
584 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  23.29 
 
 
835 aa  72  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  23.92 
 
 
465 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.51 
 
 
529 aa  64.7  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  45.57 
 
 
573 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  32.17 
 
 
161 aa  62.4  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  39.29 
 
 
723 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  25.19 
 
 
591 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  21.8 
 
 
593 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  28.57 
 
 
689 aa  57.4  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0869  hypothetical protein  24.83 
 
 
387 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.420946  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  26.47 
 
 
606 aa  55.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  34.48 
 
 
780 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1064  hypothetical protein  36.84 
 
 
130 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.49397  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  28.19 
 
 
201 aa  52.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  40.86 
 
 
779 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  40.86 
 
 
779 aa  52  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25 
 
 
593 aa  52  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  44.07 
 
 
165 aa  51.6  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  33.64 
 
 
564 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2723  hypothetical protein  36 
 
 
346 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00564197  normal  0.585606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  26.34 
 
 
580 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  36 
 
 
680 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  23.4 
 
 
619 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  24.62 
 
 
646 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  24.9 
 
 
498 aa  47  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  22.32 
 
 
451 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  23.79 
 
 
432 aa  46.6  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  36.56 
 
 
649 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  35.87 
 
 
615 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0725  hypothetical protein  32.43 
 
 
429 aa  44.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.629722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  31.73 
 
 
577 aa  44.3  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  31.51 
 
 
458 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  25.6 
 
 
563 aa  43.9  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>