78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4610 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  100 
 
 		 656 aa  1352    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  41.6 
 
 		 696 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  37.79 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.86 
 
 		 641 aa  349  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  31.75 
 
 		 621 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  30.58 
 
 		 669 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  28.1 
 
 		 629 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  28.1 
 
 		 695 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.82 
 
 		 726 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  29.37 
 
 		 785 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  27.38 
 
 		 609 aa  198  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  26.99 
 
 		 656 aa  177  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  25.64 
 
 		 656 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  27.18 
 
 		 842 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  26.36 
 
 		 659 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.61 
 
 		 772 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  23.56 
 
 		 689 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.97 
 
 		 699 aa  114  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  27.54 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  27.54 
 
 		 697 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  29.98 
 
 		 722 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.93 
 
 		 699 aa  109  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  26.39 
 
 		 695 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  25.48 
 
 		 707 aa  108  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  23.56 
 
 		 690 aa  108  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  28 
 
 		 704 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  22.07 
 
 		 561 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  21.58 
 
 		 687 aa  99.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 		 526 aa  97.8  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.66 
 
 		 700 aa  91.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  23.45 
 
 		 559 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  23.39 
 
 		 692 aa  87.8  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  20.45 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  24.37 
 
 		 590 aa  83.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  26.42 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  19.6 
 
 		 552 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  22.22 
 
 		 569 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  20.41 
 
 		 573 aa  70.5  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  21.72 
 
 		 619 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  25.93 
 
 		 596 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  33.64 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  33.64 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  22.07 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  21.71 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  29.91 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  33.63 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  20.05 
 
 		 574 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  32.24 
 
 		 573 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.13 
 
 		 600 aa  56.2  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  33.01 
 
 		 580 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.7 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  22.35 
 
 		 600 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  25.19 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  25.9 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  33.66 
 
 		 723 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05400  Protein of unknown function (DUF1524)  30.86 
 
 		 161 aa  52  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.540977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  30.28 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  30.28 
 
 		 465 aa  51.6  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  38.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  30.23 
 
 		 539 aa  51.6  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.92 
 
 		 591 aa  51.2  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.31 
 
 		 385 aa  50.8  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  20.34 
 
 		 568 aa  50.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  19.57 
 
 		 550 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  25.63 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  29.77 
 
 		 562 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0725  hypothetical protein  31 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.629722  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  33.65 
 
 		 689 aa  48.5  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  20.88 
 
 		 201 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  23.91 
 
 		 593 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  30 
 
 		 578 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  34.04 
 
 		 649 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  26.83 
 
 		 529 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.81 
 
 		 555 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  29.7 
 
 		 664 aa  44.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  28.28 
 
 		 593 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  24.4 
 
 		 722 aa  43.9  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>