59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0823 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  30.5 
 
 
609 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  27.09 
 
 
695 aa  69.3  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  29.95 
 
 
353 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  29.44 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.54 
 
 
842 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.26 
 
 
726 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  28.57 
 
 
656 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  28.73 
 
 
659 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 
621 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  29.9 
 
 
785 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.84 
 
 
573 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.57 
 
 
631 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  25.14 
 
 
689 aa  58.2  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  30.56 
 
 
687 aa  55.1  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  27.22 
 
 
695 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  27.27 
 
 
559 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  28.71 
 
 
600 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  24.86 
 
 
606 aa  52.8  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  25 
 
 
571 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.86 
 
 
699 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  28.19 
 
 
722 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.12 
 
 
641 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  24.28 
 
 
596 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  26.63 
 
 
582 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  26.4 
 
 
692 aa  51.6  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  23.68 
 
 
569 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  29.03 
 
 
690 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.14 
 
 
555 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  24.34 
 
 
561 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  24.6 
 
 
669 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  28.02 
 
 
697 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  28.02 
 
 
697 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  22.75 
 
 
590 aa  49.3  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.63 
 
 
772 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  27.1 
 
 
600 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.31 
 
 
562 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  24.31 
 
 
562 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  20.88 
 
 
656 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  23.92 
 
 
573 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  24.23 
 
 
526 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.04 
 
 
573 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.86 
 
 
584 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  24.86 
 
 
584 aa  46.6  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  27.66 
 
 
704 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.57 
 
 
700 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  25.49 
 
 
689 aa  45.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  27.27 
 
 
490 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  27.17 
 
 
707 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  25.91 
 
 
568 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  24.15 
 
 
629 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  24.44 
 
 
585 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
539 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  27.23 
 
 
619 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  25.63 
 
 
835 aa  42.7  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.96 
 
 
550 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.78 
 
 
699 aa  42.4  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  26.11 
 
 
465 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  26.11 
 
 
465 aa  42.4  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>