79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0174 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
526 aa  1078    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  35.92 
 
 
559 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  30.25 
 
 
561 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  29.48 
 
 
568 aa  236  6e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  29.13 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  28.42 
 
 
573 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  30.02 
 
 
571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  28.06 
 
 
573 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  30.51 
 
 
552 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  30.71 
 
 
574 aa  207  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  28.23 
 
 
569 aa  206  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.5 
 
 
555 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  26.59 
 
 
578 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  23.87 
 
 
619 aa  130  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  27.57 
 
 
555 aa  127  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  23.83 
 
 
582 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.19 
 
 
656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  24.51 
 
 
695 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  27.45 
 
 
573 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.44 
 
 
772 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.34 
 
 
631 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 
722 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  23.1 
 
 
659 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.87 
 
 
699 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  22.59 
 
 
591 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  22.39 
 
 
689 aa  97.8  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  23.16 
 
 
539 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  26.45 
 
 
656 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.04 
 
 
842 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  22.74 
 
 
656 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  26.12 
 
 
590 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.6 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  25.79 
 
 
695 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  24.01 
 
 
562 aa  94.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  24.56 
 
 
697 aa  93.6  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  21.53 
 
 
600 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  24.55 
 
 
621 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  23.84 
 
 
692 aa  91.3  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  25.09 
 
 
707 aa  90.9  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  24.3 
 
 
697 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  22.51 
 
 
619 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  23.3 
 
 
704 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.2 
 
 
699 aa  88.2  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.53 
 
 
726 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.32 
 
 
641 aa  84.7  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  22.18 
 
 
550 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.6 
 
 
700 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  29.91 
 
 
584 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  29.91 
 
 
584 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  30.91 
 
 
353 aa  79  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  45.71 
 
 
172 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  24.4 
 
 
696 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  23.81 
 
 
609 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  24.14 
 
 
785 aa  73.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  22.86 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.23 
 
 
529 aa  72.4  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  30.86 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  23.35 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.13 
 
 
385 aa  67.8  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.98 
 
 
596 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  23.29 
 
 
687 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  22.42 
 
 
690 aa  65.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  24.15 
 
 
689 aa  60.5  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  36.73 
 
 
585 aa  60.5  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  25.99 
 
 
606 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  24.12 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  23 
 
 
490 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  24.88 
 
 
593 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  29.71 
 
 
223 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  26.98 
 
 
573 aa  50.4  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  24.39 
 
 
564 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  26.7 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  26.7 
 
 
465 aa  47.8  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  27.19 
 
 
600 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  24.23 
 
 
201 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  35.62 
 
 
563 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  22.58 
 
 
723 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  24.36 
 
 
646 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  19.93 
 
 
588 aa  43.5  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>