91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1103 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  100 
 
 		 726 aa  1480    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  42.98 
 
 		 695 aa  524  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.02 
 
 		 641 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.03 
 
 		 631 aa  255  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  30.86 
 
 		 785 aa  244  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  31.03 
 
 		 609 aa  240  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  28.39 
 
 		 621 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  27.82 
 
 		 656 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  27.81 
 
 		 629 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  25.91 
 
 		 669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  25.89 
 
 		 696 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  25.68 
 
 		 656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  26.18 
 
 		 659 aa  154  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  25.79 
 
 		 692 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  27.73 
 
 		 697 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  27.42 
 
 		 697 aa  139  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  27.38 
 
 		 842 aa  137  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  24.59 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  24.38 
 
 		 690 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.14 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  23.63 
 
 		 656 aa  128  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  27.5 
 
 		 699 aa  127  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  27.56 
 
 		 722 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  26.74 
 
 		 707 aa  123  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.99 
 
 		 699 aa  120  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  26.14 
 
 		 704 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  24.39 
 
 		 687 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.45 
 
 		 772 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  26.07 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.96 
 
 		 596 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  25.88 
 
 		 574 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  23.06 
 
 		 569 aa  105  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.1 
 
 		 600 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  24.88 
 
 		 695 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  31.23 
 
 		 353 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  23.33 
 
 		 582 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  22.66 
 
 		 552 aa  97.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  23.1 
 
 		 561 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  22.44 
 
 		 619 aa  95.5  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  32.63 
 
 		 573 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  31.2 
 
 		 573 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  24.72 
 
 		 578 aa  93.6  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  24.58 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  31.64 
 
 		 571 aa  92.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  23.4 
 
 		 591 aa  87.8  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.09 
 
 		 529 aa  87.4  8e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  22.53 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  22.2 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  23.44 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  23.8 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.27 
 
 		 555 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  26.35 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  25.1 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  25.1 
 
 		 584 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  28.36 
 
 		 585 aa  72  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  24.26 
 
 		 201 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  25.51 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  22.9 
 
 		 593 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  26.09 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  26.47 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  26.47 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  22.78 
 
 		 568 aa  63.9  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  24.9 
 
 		 689 aa  61.6  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.36 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  22.33 
 
 		 562 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  28.16 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  35.09 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  22.09 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  24.51 
 
 		 663 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.9 
 
 		 600 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  24.57 
 
 		 573 aa  53.9  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  23.31 
 
 		 664 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  22.08 
 
 		 564 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  25.66 
 
 		 573 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  37.8 
 
 		 499 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  34.75 
 
 		 779 aa  51.6  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  34.75 
 
 		 779 aa  51.6  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  30.91 
 
 		 498 aa  51.2  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  23.46 
 
 		 835 aa  51.2  0.00006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  21.72 
 
 		 646 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  21.1 
 
 		 451 aa  48.9  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  23.14 
 
 		 606 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  29.19 
 
 		 588 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  33.33 
 
 		 593 aa  48.1  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  28.68 
 
 		 172 aa  47.8  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  38.82 
 
 		 470 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  22.59 
 
 		 723 aa  47.4  0.0009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0564  hypothetical protein  19.82 
 
 		 504 aa  47  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.755546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  20.4 
 
 		 709 aa  46.2  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  24 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  37.18 
 
 		 471 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>