78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0548 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1374    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  35.07 
 
 
621 aa  372  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  33.67 
 
 
641 aa  334  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  31.84 
 
 
629 aa  327  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.25 
 
 
631 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  31.19 
 
 
696 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  30.58 
 
 
656 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  30.38 
 
 
785 aa  234  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  27.36 
 
 
609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  27.51 
 
 
695 aa  197  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.6 
 
 
726 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  25.34 
 
 
656 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.62 
 
 
699 aa  150  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  26.45 
 
 
842 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.77 
 
 
695 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  23.88 
 
 
659 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  24.78 
 
 
697 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  25.07 
 
 
697 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.45 
 
 
772 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  23.32 
 
 
656 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  25.15 
 
 
690 aa  127  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  23.91 
 
 
704 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.48 
 
 
699 aa  117  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  22.24 
 
 
687 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  23.87 
 
 
722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  24.52 
 
 
692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.64 
 
 
700 aa  110  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  21.02 
 
 
689 aa  110  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  23.57 
 
 
707 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  27.52 
 
 
353 aa  99  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  22.93 
 
 
561 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  26.28 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  28.43 
 
 
559 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  21.93 
 
 
539 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  26.07 
 
 
582 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  22.09 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  21.64 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  20.23 
 
 
552 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  25.26 
 
 
529 aa  69.3  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  30.86 
 
 
526 aa  68.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  21.95 
 
 
584 aa  67.4  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  22.45 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  24.68 
 
 
550 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  22.57 
 
 
465 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  22.57 
 
 
465 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  25.73 
 
 
619 aa  63.2  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  25.74 
 
 
591 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  21.98 
 
 
571 aa  61.2  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  33.64 
 
 
596 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  36.73 
 
 
569 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  25.41 
 
 
689 aa  56.6  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  35.56 
 
 
590 aa  56.2  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  30.56 
 
 
585 aa  55.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  31.87 
 
 
555 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  34.53 
 
 
172 aa  55.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  32.32 
 
 
578 aa  54.7  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  32.22 
 
 
593 aa  54.7  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  23.79 
 
 
574 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  22.86 
 
 
490 aa  52.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  34.85 
 
 
573 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  22.7 
 
 
552 aa  51.2  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  29.47 
 
 
723 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  36.47 
 
 
580 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  29.67 
 
 
588 aa  50.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  29.37 
 
 
709 aa  50.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  27.84 
 
 
568 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  21.49 
 
 
600 aa  50.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  24.6 
 
 
201 aa  49.7  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  28.12 
 
 
564 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  36.71 
 
 
562 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  36.71 
 
 
562 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  33.67 
 
 
223 aa  48.9  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  34.88 
 
 
619 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  28.57 
 
 
563 aa  48.5  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  29.76 
 
 
680 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.57 
 
 
555 aa  46.6  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  21.6 
 
 
606 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  29.49 
 
 
573 aa  44.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>