16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0725 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0725  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  854    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.629722  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  25.38 
 
 
835 aa  71.6  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  24.07 
 
 
659 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  23.3 
 
 
689 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  29.66 
 
 
590 aa  50.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  31 
 
 
656 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  20.14 
 
 
697 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  21.28 
 
 
697 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.15 
 
 
555 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  33.33 
 
 
656 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  19.63 
 
 
574 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  25.44 
 
 
609 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  32.43 
 
 
722 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.28 
 
 
772 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  21.91 
 
 
699 aa  43.9  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  30 
 
 
580 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>