101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3929 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  57.29 
 
 
569 aa  697    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  54.83 
 
 
571 aa  636    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1176    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  52.72 
 
 
573 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  52.55 
 
 
573 aa  617  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  43.66 
 
 
578 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  37.23 
 
 
555 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  32.87 
 
 
561 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  28.52 
 
 
568 aa  241  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  28.97 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  28.42 
 
 
559 aa  220  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  30.71 
 
 
526 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  28.24 
 
 
552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.31 
 
 
656 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  26.77 
 
 
704 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  25.94 
 
 
590 aa  132  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  25.08 
 
 
659 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.83 
 
 
842 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  25.08 
 
 
722 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  22.3 
 
 
539 aa  124  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  24.82 
 
 
656 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  23.4 
 
 
600 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  25.17 
 
 
584 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  25.46 
 
 
584 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.66 
 
 
699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.31 
 
 
726 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  22.52 
 
 
582 aa  111  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  25.98 
 
 
697 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  25.98 
 
 
697 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.44 
 
 
596 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.51 
 
 
699 aa  106  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  24.8 
 
 
593 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.46 
 
 
772 aa  103  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  23.3 
 
 
550 aa  103  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.17 
 
 
700 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.15 
 
 
641 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  23.08 
 
 
687 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.3 
 
 
695 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  22.86 
 
 
580 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  24.15 
 
 
619 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
707 aa  97.8  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  22.24 
 
 
619 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  23.09 
 
 
690 aa  92.8  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  23.74 
 
 
591 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  23.28 
 
 
573 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  22.75 
 
 
689 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  30.51 
 
 
695 aa  89.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  22.3 
 
 
689 aa  86.3  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  24.3 
 
 
609 aa  85.9  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  28.1 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  28.1 
 
 
465 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  26.01 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  27.44 
 
 
629 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.96 
 
 
385 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  29.29 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  25.17 
 
 
562 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  25.17 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  22.74 
 
 
692 aa  77.4  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  22.93 
 
 
564 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  27.78 
 
 
785 aa  76.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  28.64 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  24.32 
 
 
621 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  25 
 
 
723 aa  70.5  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  26.06 
 
 
680 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  28.62 
 
 
631 aa  68.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0564  hypothetical protein  23.03 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.755546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 
555 aa  67.4  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  24.72 
 
 
563 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.18 
 
 
600 aa  65.9  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  24.12 
 
 
588 aa  65.1  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  28.1 
 
 
649 aa  64.3  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  24.83 
 
 
669 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  22.03 
 
 
606 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  26.54 
 
 
223 aa  61.6  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  22.96 
 
 
573 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  41.54 
 
 
593 aa  61.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  24.28 
 
 
835 aa  60.1  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  23.67 
 
 
612 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  20.66 
 
 
490 aa  58.9  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  24.05 
 
 
664 aa  58.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  20.05 
 
 
656 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  24.53 
 
 
663 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  29.6 
 
 
172 aa  54.7  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  38.36 
 
 
432 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  31.58 
 
 
322 aa  51.2  0.00005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  25.91 
 
 
709 aa  51.2  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  29.17 
 
 
451 aa  50.4  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  22.73 
 
 
696 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  35.06 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  21.32 
 
 
201 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2178  hypothetical protein  36.19 
 
 
234 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  28.41 
 
 
779 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  28.41 
 
 
779 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  32.97 
 
 
646 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  38.98 
 
 
82 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  30.91 
 
 
601 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  37.97 
 
 
470 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  31.71 
 
 
602 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  34.85 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  33.8 
 
 
471 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>