42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4568 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4568  protein of unknown function DUF1524 RloF  100 
 
 
385 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  23.8 
 
 
574 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.7 
 
 
573 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  24.94 
 
 
539 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  24.94 
 
 
561 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  22.44 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.21 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  25.13 
 
 
526 aa  67.8  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  23.54 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  24.26 
 
 
571 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  24.88 
 
 
590 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  23.66 
 
 
568 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  22.58 
 
 
578 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  22.76 
 
 
562 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.02 
 
 
562 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  24.08 
 
 
656 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  22.78 
 
 
591 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  21.82 
 
 
555 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  23.34 
 
 
842 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23.97 
 
 
584 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  22.99 
 
 
609 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  24.46 
 
 
584 aa  53.1  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  23.12 
 
 
697 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  27.31 
 
 
656 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  22.96 
 
 
621 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  23.1 
 
 
704 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  30.77 
 
 
552 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.62 
 
 
699 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.07 
 
 
689 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  29.25 
 
 
573 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  26.67 
 
 
580 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  23.12 
 
 
697 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  20.3 
 
 
555 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  29.84 
 
 
559 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19080  hypothetical protein  25.66 
 
 
612 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  0.155007 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  23.4 
 
 
585 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.51 
 
 
699 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  20.89 
 
 
619 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  32.38 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  21.57 
 
 
687 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  24.52 
 
 
593 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  25.3 
 
 
659 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>