50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1353 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
577 aa  1122    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  34.04 
 
 
602 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0809  hypothetical protein  27.41 
 
 
570 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  30.46 
 
 
601 aa  170  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  24.05 
 
 
615 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  40.87 
 
 
559 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  30.81 
 
 
499 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  35.05 
 
 
656 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  29.86 
 
 
593 aa  57.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.36 
 
 
700 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  32.11 
 
 
692 aa  54.7  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  38.2 
 
 
619 aa  53.9  0.000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  29.13 
 
 
709 aa  53.9  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  27.15 
 
 
591 aa  53.9  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  39.44 
 
 
550 aa  53.9  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  30.63 
 
 
471 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  32.1 
 
 
659 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  37.66 
 
 
680 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  28.5 
 
 
573 aa  52.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  36.67 
 
 
568 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  44.29 
 
 
690 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  34.96 
 
 
172 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  24.31 
 
 
498 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  27.47 
 
 
580 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  26.91 
 
 
606 aa  50.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.32 
 
 
656 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  36.67 
 
 
563 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  32.99 
 
 
555 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  36.25 
 
 
646 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  32.93 
 
 
564 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  39.13 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  39.13 
 
 
584 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  33.91 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  37.65 
 
 
539 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  40.85 
 
 
588 aa  47.8  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  37.08 
 
 
723 aa  47.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  35.53 
 
 
432 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  34.41 
 
 
593 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  33.8 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  33.8 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  35.62 
 
 
689 aa  46.6  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  35.06 
 
 
835 aa  46.2  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  36.05 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  37.97 
 
 
562 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  34.62 
 
 
582 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  31.73 
 
 
722 aa  44.3  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  30.89 
 
 
780 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  25.49 
 
 
778 aa  44.3  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0112  hypothetical protein  38.81 
 
 
127 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  36.05 
 
 
649 aa  43.9  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>