40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1143 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1143  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.046118  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  43.93 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  39.87 
 
 		 492 aa  104  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  41.26 
 
 		 756 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  40.3 
 
 		 705 aa  99.4  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  36.84 
 
 		 778 aa  89  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  38.68 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0287  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00361715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3359  divergent AAA region  36.11 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  49.25 
 
 		 489 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  36.36 
 
 		 764 aa  72  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  43.66 
 
 		 561 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  32.22 
 
 		 390 aa  52.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 556 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  38.27 
 
 		 412 aa  49.3  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0343  AAA-4 family protein  41.67 
 
 		 548 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  32.93 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 499 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1402  putative transcriptional regulator  40.82 
 
 		 551 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0947  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 446 aa  46.6  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000653494  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 430 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  34.18 
 
 		 413 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3256  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 545 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1244  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 455 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  35.38 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  52.27 
 
 		 433 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.144243  hitchhiker  0.00001391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  42.65 
 
 		 555 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  34.33 
 
 		 498 aa  42.7  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 494 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  32.84 
 
 		 403 aa  42  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 403 aa  42  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>