66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5703 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3980  putative transcriptional regulator  58.49 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00414076  normal  0.398554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  38.28 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  35.32 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  35.16 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3236  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.43358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2209  putative transcriptional regulator  32.06 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000825903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0166  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1101  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 402 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000119822  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4703  putative transcriptional regulator  27.95 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 469 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0157  AAA ATPase  30.26 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  31.3 
 
 		 396 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1892  hypothetical protein  30.22 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2526  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000101247 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 374 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3983  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 484 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2738  putative transcriptional regulator  28.75 
 
 		 561 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0657  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 385 aa  52.8  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1606  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 		 386 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.906529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 		 485 aa  52  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0813  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 467 aa  51.2  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.12457 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0057  hypothetical protein  34 
 
 		 555 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3194  ATP-dependent DNA helicase RecG domain protein  26.95 
 
 		 403 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.404765  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2795  putative transcriptional regulator  26.95 
 
 		 403 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  34.78 
 
 		 489 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1081  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 		 492 aa  48.9  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1526  hypothetical protein  28.09 
 
 		 479 aa  48.9  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000462658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3019  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 65 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 471 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  30.07 
 
 		 389 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1753  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 485 aa  46.2  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0101  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 663 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220475  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0558  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 556 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  32.41 
 
 		 430 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0889  putative transcriptional regulator  28.47 
 
 		 463 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 494 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 455 aa  45.4  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  34.19 
 
 		 483 aa  45.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 138 aa  45.4  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  32.38 
 
 		 499 aa  45.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0061  putative transcriptional regulator  27.56 
 
 		 467 aa  45.4  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0344  AAA-4 family protein  34.33 
 
 		 199 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0785  putative transcriptional regulator  25.69 
 
 		 412 aa  44.7  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  30 
 
 		 396 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 		 304 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0093  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 545 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0042  divergent AAA domain family  26.67 
 
 		 462 aa  43.9  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264071  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 360 aa  43.9  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3447  putative transcriptional regulator  38.03 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0678307  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2603  putative transcriptional regulator  27.93 
 
 		 469 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00960244  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0868  putative transcriptional regulator  29.25 
 
 		 454 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00767556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5330  putative transcriptional regulator  28.76 
 
 		 313 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01810  predicted transcriptional regulator with HTH domain  28.79 
 
 		 456 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6893  putative transcriptional regulator  36.79 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.195697  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  28.1 
 
 		 167 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3313  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  27.74 
 
 		 167 aa  42  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  29.46 
 
 		 543 aa  41.6  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>