19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1824 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  100 
 
 
304 aa  624  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 
300 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 
374 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  36.42 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1940  hypothetical protein  34.38 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1825  hypothetical protein  34.65 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  29.35 
 
 
377 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2335  hypothetical protein  29.69 
 
 
191 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2052  hypothetical protein  26.77 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.31699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2457  hypothetical protein  29.13 
 
 
190 aa  59.7  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0663583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2681  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00455306  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0712  putative transcriptional regulator  26.88 
 
 
381 aa  52.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.852525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2531  hypothetical protein  34.09 
 
 
101 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.660934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0693  hypothetical protein  31.54 
 
 
129 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1735  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 
396 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256151  normal  0.15639 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2925  divergent AAA-4 ATPase related protein  30.52 
 
 
407 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  32.92 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  27.41 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.643382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>