17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4294 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4294  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1824  putative transcriptional regulator  33.11 
 
 		 304 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1940  hypothetical protein  37.01 
 
 		 128 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194852 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1825  hypothetical protein  36.22 
 
 		 126 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2335  hypothetical protein  32.84 
 
 		 191 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2457  hypothetical protein  28.78 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0663583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2052  hypothetical protein  31.39 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.31699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2531  hypothetical protein  40.24 
 
 		 101 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.660934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2681  hypothetical protein  28.81 
 
 		 125 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00455306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0799  putative transcriptional regulator  30.46 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2890  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0693  hypothetical protein  28.46 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  30.39 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3018  hypothetical protein  32.23 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0293941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 208 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04685  succinate dehydrogenase  24.83 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>