26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0557 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0557  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 360 aa  743    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2059  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00686529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1016  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1740  putative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 230 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.952214  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0967  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 241 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2082  hypothetical protein  31.25 
 
 		 396 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00946987  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  27.67 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1398  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 160 aa  51.2  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2864  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 319 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1509  putative transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.452011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2313  putative transcriptional regulator  30.28 
 
 		 417 aa  49.3  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.584099  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  23.04 
 
 		 218 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  26.58 
 
 		 207 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0215  putative transcriptional regulator  30.47 
 
 		 209 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000133707  decreased coverage  0.0059544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3010  hypothetical protein  27.01 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1587  putative transcriptional regulator  32.04 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1428  putative transcriptional regulator  26.23 
 
 		 620 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00334875  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0830  putative transcriptional regulator  26.53 
 
 		 478 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.702449 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0617  ATPase central domain-containing protein  28.23 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0631  ATPase central domain-containing protein  28.23 
 
 		 377 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 471 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24770  predicted transcriptional regulator with HTH domain protein  30.28 
 
 		 387 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.307493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  28 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>