25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3019 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3019  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 65 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0539  putative transcriptional regulator  45.9 
 
 		 430 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1090  putative transcriptional regulator  51.02 
 
 		 448 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.846726  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1210  putative transcriptional regulator  53.49 
 
 		 448 aa  51.2  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1088  putative transcriptional regulator  46.55 
 
 		 346 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.41484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2782  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 471 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1666  putative transcriptional regulator  41.54 
 
 		 430 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2462  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 480 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5703  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.643382 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0620  putative transcriptional regulator  54.76 
 
 		 469 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00572222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1706  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 		 480 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.383518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 499 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 485 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1399  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 494 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0507  divergent AAA ATPase  38.89 
 
 		 483 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  37.5 
 
 		 778 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0329  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 455 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.024983  hitchhiker  0.000000313629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0637  putative transcriptional regulator  52.27 
 
 		 456 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2157  AAA-4 family protein  44 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.475743  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0553  putative transcriptional regulator  37.88 
 
 		 489 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1518  putative transcriptional regulator  34.85 
 
 		 498 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1271  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0667  putative transcriptional regulator  36.54 
 
 		 334 aa  40.4  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2295  putative transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.619518  hitchhiker  0.00086981 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1712  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.111866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>